Batman Beyond menawarkan sentuhan baru yang unik pada mitos Batman yang sudah dikenal. Dan sementara DC Animated Universe melakukan pekerjaan yang menarik dalam menyiapkan banyak kontinuitas animasi yang menyeluruh, Batman Beyond mengembangkan cerita itu ke masa depan dan menunjukkan akhir untuk karakter komik yang jarang bisa dijabarkan. Dalam beberapa kasus, karakter mendapatkan akhir yang bahagia yang selalu pantas mereka dapatkan, tetapi mungkin tragedi terbesar DCAU adalah sahabat karib Batman, Robin, dan nasib yang menimpanya di tangan Joker.
Di timeline saat ini Batman: Seri Animasi, Bruce menemukan sesama yatim piatu Dick Grayson dan membawanya di bawah sayapnya. Duo dinamis Batman dan Robin akan melawan kejahatan berkali-kali, tetapi akhirnya, perpecahan berkembang dalam kemitraan mereka dan Dick pindah ke Blüdhaven terdekat untuk menjadi Nightwing. Seorang yatim piatu baru, Tim Drake muda, menjadi Robin baru, dan Batman Beyond: Kembalinya Joker akhirnya akan mengungkapkan nasibnya di DCAU.
Kisah Drake di DCAU selalu merupakan campuran karakter dari komik dan Jason Todd, paling dikenal sebagai Robin yang mati di tangan Joker. Dalam komik, Todd kemudian kembali menghantui Batman sebagai Red Hood, pengingat dosa masa lalu yang menyeramkan. DCAU berhasil memukul banyak dari ketukan yang sama ini menggunakan Drake sambil menempatkan putaran unik mereka sendiri di atasnya.
Di Kembalinya Joker , Batman baru tahun 2040 mengetahui bahwa sebelum Bruce Wayne pensiun dan semakin terisolasi dari orang-orang di sekitarnya, dia dan Tim Drake memiliki pertarungan terakhir dengan Joker. Setelah Tim menghilang selama 3 minggu, Batman menemukannya di Arkham Asylum yang ditinggalkan dimana ternyata Joker menyiksanya untuk mendapatkan informasi dan mencuci otaknya menjadi min-Joker. Remaja yang sangat terganggu itu menyalakan Joker dan tampaknya membunuhnya sekali dan untuk selamanya, selamanya membuat Tim trauma dan memaksanya untuk pensiun.
Tapi cerita Tim masih jauh dari selesai. Tepat ketika Joker tampaknya selamat dari kematiannya, Kembalinya Joker mengungkapkan Pangeran Badut Kejahatan dan Tim Drake adalah satu dan sama. Sementara Tim adalah tawanan Joker, penjahat itu mengkodekan DNA-nya dengan teknologi eksperimental yang dapat menggantikan tubuh dan pikiran Tim dengan atribut fisik dan mental dirinya. Itu berarti bahwa Joker tidak hanya berhasil selamat dari kematiannya tetapi juga menambahkan penghinaan terhadap luka psikis yang luas pada Batman di atasnya.
Dengan kontinuitas DCAU yang sering menempatkan putarannya sendiri pada peristiwa dari komik, Drake menjadi Joker secara bersamaan adalah salah satu cara paling inventif dan paling setia untuk mengadaptasi sebagian besar mitos Batman. Sedikit menahan diri dengan statusnya sebagai 'kartun anak-anak', film animasi ini berhasil menampilkan cerita yang kelam dan meresahkan. Batman adalah sosok yang tragis, dan apa yang terjadi dengan itu adalah mengubah orang-orang di sekitarnya menjadi makanan untuk tragedi.
