Masamune Shirow's hantu di dalam cangkang terkenal karena menangani transhumanisme dan filosofi tentang kesadaran. Transhumanisme adalah gagasan bahwa manusia dapat berevolusi melewati apa yang dapat ditawarkan oleh tubuh dan pikiran mereka sendiri dengan bantuan sains dan teknologi. Melalui mata protagonis serial Makoto Kusanagi, alias The Major, pemirsa dapat melihat bagaimana ide-ide ini dapat mempengaruhi masyarakat. Sebuah video game berdasarkan konsep akan sangat cocok untuk waralaba, selama cerita yang solid dapat mendukungnya.
UNTUK hantu di dalam cangkang pengalaman orang ketiga akan memungkinkan pemain untuk mengontrol Major saat ia mendaki gedung tinggi cyberpunk Jepang, memecahkan kasus untuk Keamanan Publik Bagian 9. Mengikuti tutorial singkat, plot akan berputar di sekitar teknologi realitas virtual baru yang tampaknya mencuri kesadaran pemainnya, meninggalkan tubuh mereka katatonik. Karena Mayor sudah sepenuhnya cybernetic dan 'hantu' atau jiwanya tidak asing dengan bentuk bergerak, dia adalah kandidat utama untuk menjelajah ke teknologi ini dan mengungkap misteri.
Melalui transisi dari dunia fisik ke dunia digital, garis metafora antara siapa 'pemain' game tersebut akan menjadi kabur. Pada kenyataannya, pemain mengontrol Makoto tidak peduli apa, tetapi lubang kelinci naratif semakin dalam saat pemain mengontrol Makoto , mengendalikan dirinya. Pertanyaan yang lebih dalam tidak akan mulai muncul sampai titik tengah permainan saat dunia virtual yang dilalui pemain bertindak sebagai lingkungan yang dinamis, mengubah cuaca dan musuh sesuai keinginannya.
Saat permainan berlangsung, pemain akan bertemu orang-orang yang kesadarannya dicuri, dan mereka menjelaskan bagaimana tidak ada banyak perbedaan antara dunia virtual dan dunia mereka sendiri. Pemain dapat mempertanyakan dan bahkan membantu orang-orang ini untuk mengungkap lebih banyak cerita mereka dan pengetahuan di sekitarnya. Opsi dialog berfungsi sebagai bagian dari gagasan yang lebih besar bahwa tidak peduli apa pun yang didiami manusia, hantu merekalah yang merasakan realitas mereka. Jejak bahaya yang diikuti Makoto akan membawanya ke antagonis utama permainan dan wahyu yang tidak akan dilihat pemain datang.
Akhirnya, menghadapi kurator dari dunia VR yang berbahaya ini akan menjadi pencipta game sebagai pertempuran bos yang bukan tentang kontes fisik dan lebih merupakan pertarungan ide. Saat teknologi terus berkembang, pencipta percaya bahwa semua jiwa berhak mendapatkan kesempatan untuk kehidupan yang lebih baik di dalam mesin, sementara Makoto percaya bahwa jiwa yang sama layak mendapatkan pilihan itu. Pada akhirnya, Makoto akan mengalahkan pencipta dan membebaskan orang-orang yang ditangkap dari permainan. Beberapa pemain yang dibebaskan akan senang kembali ke dunia nyata, sementara yang lain tidak menginginkan apa pun selain kembali ke dunia itu.
Kisah aksi yang mencengangkan akan diakhiri dengan gagasan bahwa umat manusia sering mencari pelarian dari kenyataan mereka, tetapi pada akhirnya pilihan mereka berapa lama mereka ingin 'jiwa' mereka tetap berada di dunia yang sempurna. Idenya akan berfungsi sebagai meta-komentar untuk kebangkitan teknologi karena menjadi lebih dari sarana untuk pelarian. hantu di dalam cangkang adalah waralaba untuk berbicara tentang permainan video dan budaya teknologi yang berkembang dan bagaimana hal itu secara perlahan mengubah lanskap cara orang hidup dan berinteraksi. Sebuah game dengan ide dasar kehendak bebas dan pelarian akan ditawarkan narasi yang menggugah pikiran pada topik yang akan membuat pemain berbicara selama bertahun-tahun yang akan datang.
